Ferrari 499P Modificata 的混合動力系統將中後置V6內燃引擎與前軸上的電動機相結合。該系統可提供640 kW(870 cv)的最大功率輸出，不受FIA-ACO法規的阻礙。內燃機與296 GT3的動力單元架構相同，但Ferrari工程師對其進行了全面修改，以開發專用解決方案並降低總重量。與將引擎安裝在副底盤上的GT賽車相比，它具有更寶貴的結構功能。動力總成配備帶差速器的200 kW(272 cv)電動機和能量回收系統(ERS)，可在減速和制動期間為電池充電。800伏電池組是基於品牌的一級方程式賽車經驗開發的。動力單元與七速序列式變速箱相連。